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A criação do PPG-Aqüicultura, uma iniciativa da Universidade Nilton Lins em parceria com o Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia (MCTI/INPA), foi motivada pelo crescimento desta atividade produtiva na região amazônica e pela inexistência de um curso de Pós-graduação capaz de formar profissionais nesta área de conhecimento. Em 2009, a Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) aprovou o PPG-Aquicultura, com conceito 4, em nível de mestrado e de doutorado e, em 2010, a primeira turma de mestrado ingressou no curso. A expectativa é que as pesquisas geradas possam contribuir com a geração de novas tecnologias para o avanço da aquicultura na região.